Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms