Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms