Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms