Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCAF4Q8WV16 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms