Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN4Q8WUT4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRN4Q8WUT4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms