Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT1Q8TDG2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT1Q8TDG2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms