Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms