Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GIP1Q8TAE8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GIP1Q8TAE8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms