Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms