Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC112Q8NEF3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC112Q8NEF3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms