Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms