Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CHCHD4Q8N4Q1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CHCHD4Q8N4Q1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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