Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK4

COLGALT2, Procollagen galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT2Q8IYK4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COLGALT2Q8IYK4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT2Q8IYK4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT2Q8IYK4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT2Q8IYK4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT2Q8IYK4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT2Q8IYK4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COLGALT2Q8IYK4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms