Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PASD1Q8IV76 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms