Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR49Q8IV35 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms