Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms