Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSH2Q76I76 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSH2Q76I76 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms