Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
XIRP1Q702N8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP1Q702N8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms