Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BEND4Q6ZU67 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BEND4Q6ZU67 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms