Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 569.9 ms