Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms