Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOA5Q6Q788 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms