Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms