Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF449Q6P9G9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms