Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6P435 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6P435 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6P435 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6P435 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6P435 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6P435 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms