Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC41PQ6P2S7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms