Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFSP1Q6NVU6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms