Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRNP1Q6NT89 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms