Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms