Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARA3Q6AZY7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms