Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms