Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms