Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP350Q5VT06 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms