Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms