Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RSPH4AQ5TD94 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RSPH4AQ5TD94 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms