Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIVEP3Q5T1R4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms