Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms