Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SZT2Q5T011 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZT2Q5T011 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms