Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NHSL1Q5SYE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NHSL1Q5SYE7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms