Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR44Q5JSH3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR44Q5JSH3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms