Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDCA8Q53HL2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms