Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms