Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms