Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms