Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERKLQ49MI3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms