Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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