Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms