Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUS10Q3MIT2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms