Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P3H1Q32P28 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms