Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms